Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管突起细胞癌的预后生物标志物

2021-11-03 01:27:39 来源:
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这项研究旨在确定一种可以预见腹腔楔形蛋白胰脏(ESCC)病患者总体生存率(OS)的miRNAs标签。

从NCBI GEO获得119名ESCC病患者的miRNA表达谱及其相应的临床信息,并将其作为培训集。在后期和晚期取样近选取差异表达的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox回归系由统适度、递归特征消除(RFE)-大力支持线适度机(SVM)算法和LASSO Cox回归假设来标识预后适度miRNAs,从而设立预后总分假设。此外,预见了这些预后适度miRNAs的有忧虑靶等位基因,然后构建了miRNA靶等位基因网络。通过机能掺入系由统适度,系由统适度了ESCC中这些预后适度miRNAs预见靶等位基因的机能依赖适度。

在培训集中,后期与晚期取样有46个DEmiRNAs。设立了基于5个miRNAs的危险适度总分假设。该5-miRNA危险适度总分可以将培训集可分OS时近段轻微不同的高危组和低危组。在一个来自胰脏症等位基因组图集(TCGA)的分立信息集中,成功可验证了5-miRNA危险适度总分的危险适度分层能力。已确定了与这些miRNAs系由统适度的各种免疫学过程和路中,例如Wnt接收机路中、TRP通道的炎症介质通气路中和甲状腺激素接收机路中。

这项研究示意,与解剖分段系由统适度的5-miRNA标签对预见ESCC病患者的预后具有临床意义。

重构出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

本文系由梅斯医学(MedSci)原创编译整理,转载需授权!

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